具体来说，该流程大致为：
1、公司核名：准备好3-5个代理记账公司备选名称，前往南京工商局进行公司核名。
2、租房：获取南京代理记账公司的注册地址，确定代理记账公司的办公场地。
3、提交资料：准备好相应的资料，包括注册公司申请表、董事资料、注册资本、经营范围等，到工商局进行注册材料提交。
4、领取执照：上述注册资料通过审核后，前往工商局领取营业执照正、副本。
5、刻章：营业执照领到手，就可以去公安机关指定地点进行刻章，包括：公章、财务章、法人章、发票章、合同章。
6、银行开户：带上营业执照正副本原件、法人身份证原件等材料去银行开基本户。
7、税务登记：主要是税务登记及报到，并根据公司业务的需要决定是否要申请发票等。
至此，在南京开代理记账公司的登记流程基本完成！