一般来说，根据当前审计市场收费行情，高新技术企业审计最低收费为3000元起。同时，还与企业年末资产总额相关。具体为：

年末资产总额1000万元以下(含1000万元)(‰)：2.5‰；

年末资产总额1000万元以上-1亿元(含1亿元)(‰)：0.15‰；

年末资产总额1亿元以上-10亿元(含10亿元)(‰)：0.1‰；

年末资产总额10亿元以上(‰)：0.02‰。

此外，除了高新技术企业审计报告收费情况外，我们还需对高新技术企业审计所需材料进行具体把握，从而以为审计工作开展做好前期准备。具体说来，这些材料主要包括：

1、近三年度企业所得税汇算清缴申报表或审计报告(全套完整报表)

2、近三年加计扣除资料税务机关备案资料、专项审计报告(无则不用提供)

3、财务情况说明书

4、研发费相关资料，如：

(1)各年管理费用研发费用明细账(单独核算，财务系统导出);

(2)各年研发设备折旧清单(含名称、型号、原值、采购时间、月折旧、本年累计折旧等信息)，应与每年研发费中的折旧费核对相符。

(3)每年1月、3月、6月、9月、12月工资计提及发放单。

(4)每年技术开发费发票及合同。

5、各年高新技术产品收入明细表(分年按不同产品类别列表，内容包括：发生时间、凭证号、内容、金额等)、重要销售发票复印件、收入有关合同复印件.

6、知识产权证书复印件

7、研发项目立项证明(科技部门立项文件或自行立项报告，自行立项的需有主管人员审批签字)、项目完成情况明细表

8、研究开发活动说明材料——项目研究开发的效用情况说明、研究成果报告等资料

9、建立研发投入核算制度、产学研合作证明、研发机构证明(省市区研发中心确认文件或组织机构图)、研发设备清单、研发人员的绩效考核奖励制度。

10、研发人员名册(内容包括：姓名、学历、专业、职称)，缴纳社保情况证明，近三年12月研发人员工资单等。